組合議会は、組合の運営に関する事項や地方自治法に基づく議決事件に対する話し合い等を行い、条例や予算等の重要事項を決定する機関です。
組合議会議員の定数は14人で、八幡浜市から9人、伊方町から5人が選出されます。
組合議会の定例会は、年2回（3月と12月）開催され、必要に応じて臨時会も開催されます。
（令和7年9月8日現在）
| 議席 | 氏名 | 所属 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 菊池 司郎 | 八幡浜市副市長 | |
| 2 | 杉山 啓 | 八幡浜市議会議員 | |
| 3 | 竹内 優美子 | 八幡浜市議会議員 | |
| 4 | 宮本 知里 | 八幡浜市議会議員 | |
| 5 | 鎌田 浩 | 八幡浜市議会議員 | |
| 6 | 平野 良哉 | 八幡浜市議会議員 | |
| 7 | 遠藤 綾 | 八幡浜市議会議員 | |
| 8 | 佐々木 加代子 | 八幡浜市議会議員 | |
| 9 | 菊池 隼人 | 伊方町副町長 | |
| 10 | 福島 大朝 | 伊方町議会議長 | 副議長 |
| 11 | 阿部 孝志 | 伊方町議会議員 | |
| 12 | 加藤 智明 | 伊方町議会議員 | |
| 13 | 中村 敏彦 | 伊方町議会議員 | |
| 14 | 菊池 彰 | 八幡浜市議会議長 | 議長 |
